certo che puoi fare un sito miso , asp e asp.net
i link di volta in volta saranno rivolti a pagine .asp e pagine .aspx

avrai 2 stringhe di connessione (anche se identiche) cioè scritte in 2 punti diversi ma per il resto funzia tutto.

attenzione che le sessioni create nell'uno non vengono viste dall'altro almeno di non avere win2003 (puoi risolvere con i cookies)