Continui ad essere vago... ma non esiste una funzione o metodo che realizzi una pausa nell'esecuzione di uno script. Devi spezzare la sequenza delle istruzioni in piu' funzioni e richiamare la successiva alla fine della precedente cosi':
window.setTimeout("funzioneSeguente()",5000)
il secondo parametro indica l'attesa in millisecondi.
ciao