dovresti esportare tutte le tabelle su file di testo e importrle nuovamente in 1 unico db. Non ti so dire con esatezza come procedere xchè tutto dipende dal tipo di archivio (interbase,mysql,sqlserver, ec... )e la sintassi dei comandi potrebbe essere diversa. Su internet troverai certamente articoli su come esportare una o + tabelle su di un file.