Ciao.. Senti io non conosco la classe che tu utilizzi, ma ne conosco un'altra che uso e con cui mi son trovato e mi trovo molto bene; è la classe MultipartRequest; essa è scaricabile al seguente link:
O'reilly Servlet

La uso da molto e non mi ha dato mai nessun tipo di problema.
Ti do anche il numero e l'anno di un articolo di Mokabyte sull'upload dei file in maniera tale che tu ti renda conto di come essa funzioni:

MokaByte Numero 37 - Gennaio 2000
FileUpload con
i Servlet

Spero ti sia d'aiuto...
Ciao