che intendi per includere file js?
lo puoi fare staticamente in HTML così!
<script src="file.js"></script>

se ti interessa invece partecipare alla costruzione di una libreria in JS ecco qua... http://forum.wedev.it/
stiamo facendo delle funzioni per JS e DHTML moooolto interessanti... tra le quali... ho fatto una che include proprio file JS al volo...