La pagina che appare all'interno del parametro SRC dell'IFRAME viene seguita, a volte.
Tuttavia viene trattata come una normale pagina aggiuntiva, per giunta ad un "livello gerarchico" più basso. Quindi se il PR della pagina "madre" è molto basso, Google potrebbe decidere di non indicizzarla subito. In questi casi l'unica è cercare di aumentare il PR oppure far trovare a Google un link che punta direttamente alla pagina nell'IFRAME.
Su webmasterworld leggevo che ad alcuni era venuto il dubbio che Google rifiutasse a priori di visitare le pagine negli IFRAME se la dimensione degli IFRAME era troppo piccola. Ma non ho fatto esperimenti personali in tal senso.