Personalmente non ho avuto quasi mai problemi di questo tipo, le poche volte che mi è accaduto era perchè avevo sbagliato qualcosa nel codice... Che programma di installazione usi?
Relativamente al problema della risoluzione, è solamente un discorso di ottimizzazione grafica del form. Invece di mettere decine e decine di controlli tutti nello stesso form (che tra l'altro disorientano l'utente), riorganizzali usando per esempio un controllo TabStrip (come per esempio la finestra Opzioni di Word).