<form name="FormFilter">
<input name="QtaFiltro" type="text" value="pippo">
</form>
<script>
alert(document.FormFilter.QtaFiltro.value)
</script>

questo funziona, ergo.... altrove nella pagina o nello script c'e' qualcosa che disturba

Verifica che i nomi degli oggetti e variabili utilizzati nella pagina siano univoci e scritti con le giuste maiuscole/minuscole.

ciao