Non ho mai provato se lo swapDepths funziona su livelli diversi ma ti assicuro che se lasci perdere i livelli e carichi gli swf in movieclip (nello stesso livello) applichi il metodo al movieclip che sicuramente funziona.
codice:
myMovieClip.swapDepths(depth)
myMovieClip.swapDepths(target)