quelli sono i sorgenti, il file .so è il corrispondente del file .dll su windows
hai ricevuto errori quando hai dato i comandi di compilazione?

prova un

updatedb && locate php_gtk.so

comunque i file .so di php dovrebbero trovarsi nella directory indicata nel php.ini alla voce extension_dir (è dove dl() va a cercare le estensioni)