Più o meno è come hai detto tu.
Alt serva per i motori di ricerca e per i disabili.Il fatto che visualizzi una targhetta è solo un "bug" di internet explorer.
Title,invece, serve proprio a mettere la targhetta di commento, ma anche lui è utile ai motori di ricerca per individuare l'argomento del sito.
Pertanto secondo me basta usare solo title (che tra l'altro si usa anche per i links) e non pensarci più...

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