L'aggiornamento del bios lo sconsiglio vivamente, perchè le probabilità di riuscita ci sono ma ci sono anche quelle di fallimento (e parecchie se si sbaglia versione, cosa abba facile) e a meno che si verifichi proprio una necessità io non lo farei perchè si corre il rischio di bruciare la scheda madre.
Per il tuo PIII è falso che non riconosce HD più grandi di 40 giga, anche perchè non sta al processore riconoscerli. Quindi se il tuo problema è il volere installare un hard disk più capiente, se hai il posto nel cabinet non ci sono problemi (conta di installare anche una ventola supplementare perchè gli HD capienti scaldano parecchio).