Con Uleaf Gif Animator per render trasparente un'area bisogna o usare la gomma oppure con la bacchetta magica selezionare il colore e poi usare taglia.
Se preferisci usare un altro programma c'è (freeware) Microsoft GIF Animator. Lo trovi, oltre che su Microsoft, anche su quasi tutti i siti di software (ZdNet, Tucows, VolftpMondadori, etc. etc.)