Se vuoi usare le cygnus, dovrai ricompilare il programma che vuoi far girare su winzozz, questo perché le cygnus forniscono sì un'infrastruttura linux di base, ma non sono un'emulatore.
Inutile dire che se nn hai il sorgente è inutile provare le cygnus.
Nel caso tu abbia il sorgente devi controllare tutte le dipendenze del programma, quindi eseguire un'installazione delle cygnus con i pacchetti necessari (utilizzando l'installer disponibile sul sito). Dopodiché devi provare una compilazione e sperare che vada.

Nel caso tu nn abbia il sorgente puoi sempre usare l'emulatore consigliato da arcobalenos (sfrutta anch'esso le cygnus), ma occhio che è una release alpha, e potrebbe contenere una caterva di bugs (chissà perché il bug-tracker sul sito è disattivato?)