il problema, se ho interpretato correttamente quanto da te scritto, è molto diffuso
e si risolverebbe con la gestione avanzata dell' oggetto event
(ci sono 3 ottimi articoli in pro.html.it)

dal momento che usi script pre-costruiti di dreamweaver (se non ho capito male)
potresti seguire un approccio diverso, molto + semplice

link menù
- onmouseout: il livello non sparisce subito ma dopo una temporizzazione
- onmouseover: prima vengono chiusi tutti i livelli (e eliminata l' eventuale temporizzazione) e poi mostrato il livello opportuno

link sub-menù
- onmouseout: come x i link menù
- onmouseover: elimina solo la temporizzazione

se non ti è chiaro come procedere a livello di script posta il codice che stai usando al momento,
mi risparmi di preparare un esempio generico che potresti trovare difficile da adattare