mi sembra strano sia passato da NTFS a Fat 32, effettuando solo il ripristino (sovrascrittura ad esempio..)

Di solito tale opzione la da nel caso in cui tu voglia formattare l'intero HD (o partizione) e li lo scegli manualmente

Ma un modo per tornare all'Ntfs, senza fare il format , ci sarebbe..ma ti occore Partition Magic 8..che purtroppo non è free :
(

Comunque se non hai particolari esigenze..io ti consiglio di lasciarlo stare come si trova..onde evitare rischi di perdita dati