Grazie, proverò a seguire il tuo consiglio.
Comunque mi sembra strano che sia causato da una versione vecchia del Bios perchè aveva funzionato per un anno. Escludo che sia un danneggiamento dei file Ntldr, Ntdetect.com o Boot.ini perchè il problema perviene solo quando metto l'hard-disk secondario che non contiene nessun area di boot (ho provato anche a formattarlo).
Se qualcuno sa dirmi cosa potrebbe essere...