Un po' poco come codice per inquadrare esattamente il problema... anche se gli errori presenti possono far intuire di cosa si tratta...

d = document.mioForm;
if (d.sitoChk1.checked || d.sitoChk2.checked) {
alert('tutto ok');
}
else
{
alert('nessona scelta');
}

La proprieta' checked di un checkbox e' di tipo boolòeano, non stringa, e restituisce True se e' selezionato, altrimenti False

ciao