ogni componente viene gestito dal layout manager del componente che lo contiene. Per impostare le coordinate in pixel devi impostare a null il layoutmanager del contenitore, per poi specificare dimensioni e posizione dei singoli componenti che vuoi aggiungere.
Per il posizionamento puoi usare o il metodo setBounds(...) oppure setSize(...) e setLocation(..).
codice:
contenitore.setLayout(null);
contenitore.add(getPrimoComponente());