per apache prova a spostare momentaneamente il file /etc/apache/httpd.conf e riprovare

per le gtk nno ci dovrebbero essere problemi al limite prova ad installare un po di temi di gtk e un po di temi per gnome che dovrebero caricarti i file necessari

per il menu di gdm prova a rimuoverlo e reinstallarlo ti dovrebbe mettere anche le voci nuove

per il login devi editare il file gdm.conf (credo in /etc/gnome o /etc/gdm non ricordo )

poi scorrendo il file trovi una riga con scritto

allow root=false e la devi cambiare in

allow root=true