Io farei una cosa del genere:

onclick="if(abil)return(apriWin1('<%=cerVia%>',300 ,300,'Cerca Vie')); else return false;"

dove abil e` una variabile globale (definita nella head, fuori dalle funzioni) che puo` assumere valori booleani.

Le tue condizioni dovranno poi mettere a true / false la variabile