Hai uno o due button? uno controlla e l'altro salva?

Puoi aggirare il problema utilizzando una variabile globale:

<script>
var cliccato = false;

function controlla() {
if (!cliccato) {
cliccato = true;
// altre istruzioni...
document.mioform.submit();
} else {
alert("Hai gia' cliccato!");
}
}
</script>

ciao