ciò alla lunga può pregiudicare il loro posizionamento?
Sì.

dopo quanto tempo è buona norma aggiornare un sito?
Non esiste un periodo.
Certo è che maggiori sono gli aggiornamenti migliore considerazione avrà il sito agli occhi dei motori ma anche dei visitatori.

ma per quest'ultimo, sempre ai fini del posizionamento, dopo quanto tempo và modificato?
Come sopra, non c'è un tempo anche perchè il layout è ininfluente per il motore.
Agli occhi di un utente invece aggiornamenti sporadici di layout denotano cura ed interesse verso il sito.