stai facendo queste modifiche come root??
apri una shell e fai:

su

metti la password da root

e digiti

vi /etc/X11/XF86Config

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premi "i" per modificare, trova la seguente riga e sistemala cm vuoi..

....
....
Modes "1024x768" "800x600" "640x480"
....
....

per ognuno dei depth, per prima la risoluzione di default


per salvare le modifiche devi:

premere il tasto "esc"

poi

:wq!

per cambiare risoluzione:

CTRL ALT + (del tastierino numerico)
CTRL ALT - (sempre tastierino numerico)