L'argomento è molto complesso e tu poni la domanda con troppo pochi dettagli affinché qualcuno possa darti un aiuto.

Posso solo cercare di darti alcune indicazioni che però hanno validità solo con determinati presupposti

Quindi assumo che tu voglia chiedere la validazione per una pagina HTML 4.1 che al suo interno ha il codice di incorporamento di un filmato Flash.

In questo caso il problema di solito è dovuto al TAG <EMBED> incluso dentro il TAG <OBJECT>.

Togliendo il TAG <EMBED> dovresti risolvere i problemi relativi al codice di incorporamento di Flash.
Il TAG <EMBED> viene solitamente incorporato dentro il TAG <OBJECT> per garantire la massima compatibilità con vecchie versioni di browser (vedi Netscape) che riconoscevano solo tale TAG.

Comunque l'argomento è molto "variegato", ti consiglio di armarti di santa pazienza e fare una ricerca sul sito del W3C
http://www.w3.org/