Ciao, tieni presente che usando una tolleranza di colore pari a 0 sull'immagine che hai postato la trasparenza viene applicata dove ora ho messo il colore rosso:



le parti esterne all'bottoncino sono dello stesso colore mentre l'interno ha 4 colori differenti.
Puoi rendere trasparente solamente un colore quindi a seconda delle tue esigenze dovrai uniformare i colori differenti per poter applicare la trasparenza correttamente.