Ho provato a visualizzare le due pagine con Moz1.4 sotto linux.
Sono perfettamente uguali.

Ho dato uno sguardo al codice, ed ho notato che quella con DTD XHTML strict, in realta` non e` scritta in XHTML, in quanto mancano i tag di chiusura di molti tag, e ci sono attributi non validi.

Esempio:
<link rel=stylesheet href='./css/2.css' type='text/css'>

dovrebbe essere:
<link rel=stylesheet href='./css/2.css' type='text/css' />

Altro esempio:
<td align="center" valign="middle">[img]./img/logo.jpg[/img]</td>

deve diventare:
<td style="text-align:center; vertical-align:middle;">[img]./img/logo.jpg[/img]</td>

(pero` gli stili andrebbero messi nel file esterno, assieme agli altri).

Quindi in questo caso IE ha ragione ad arrabbiarsi.