Hai dimenticato la terza media?

var tot = pa * ri / 100 + pa;

Non so come chiami quello script, ma se i parametri passati sono campi di form, devi scrivere:

var pa = parseFloat(prezzo_acquisto.value);
var ri = parseFloat(ricarico.value);

Alla fine devi probabilmente arrotondare (immagino che i valori siano in Euro):

document.form1.c11.value = Math.round(tot*100) / 100;