I file pdf sono gestiti da Acrobat reader.
Tale applicativo, in qualche caso, puo` essere aperto all'interno di una finestra del browser, ma la gestione dell'applciativo e` comunque del SO, mai del browser.

Non credo si possa trovare soluzione tramite programmi standard.
Magari qualche VBS o ActionScript o Jscript (tutti solo per IE) possono risolvere, ma io non sono competente in materia.