Ho risolto parzialmente con

codice:
onLoad="setTimeout('location.reload()',5000);"
nel senso che adesso la finestra non mi si apre più in primo piano però nella barra di Windows dove ci sono le varie finestre aperte, quando parte il refresh la finestra secondari si seleziona e quella che sto vedendo passa di fatto in secondo piano.
Io continuo a vedere la finestra dove sto navigando, però ad un certo punto mi vedo nella barra che si seleziona l'altra finestra nonostante io veda l'altra.

Ad es. adesso mentre scrivo qui sono su una seconda finestra. Ogni 30 secondi con il mouse devo cliccare su questa finestra perché anche se continuo a vederla mi passa in secondo piano e vedo sotto nella barra di windows selezionata la finestra dove c'è il refresh.