Hai messo virgolette dentro le virgolette.

Metti gli apici attorno ai valori della query, così:


$query_Altavilla_Irpina_Beni_Architett = "SELECT Comuni.nome_comune, Beni.nome_monumento AS Beni_Architettonici FROM Comuni INNER JOIN Beni ON (Comuni.id_localita=Beni.id_localita) AND (Comuni.codice_comune=Beni.codice_comune) WHERE (((Comuni.nome_comune)='Altavilla_Irpina') AND ((Beni.categoria)='Beni_Architettonici') AND ((Beni.descrizione)='Chiesa_Cappella')) "