Piu` o meno e` quasi giusto.

Ci sono degli errori.

Ma vuoi farlo all'onblur di ciascun campo, o con un bottone che sostituisce in tutti i campi di un certo tipo (ad esempio text e/o textarea) ?

onblur="this.value=this.value.replace(/\./g,',');"

Nota che la quadra non serve, e che non puoi innestare virgolette dentro virgolette.