Gli eseguibili in linux non hanno una estensione particolare, possono anche non averla. Per sapere se un file è eseguibile dai il comando "ls -l nomefile" e lo vedi dai permessi. Le applicazioni possono essere sotto varie cartelle (es.: /usr/local/bin, /usr/opt), però il filesystem rispetta alcune regole (esempio: gli eseguibili di sistema sono in /usr/sbin). Leggiti la parte sul filesystem dal link che ti ho dato, ti chiarirà un mucchio di cose.