Ciao, il perl a me piace molto la funzione delle Win32 API:

codice:
use Win32::API;
Win32::API->Import("kernel32.dll", 'HWND GetConsoleWindow()' ) || die;
Win32::API->Import("user32.dll", 'BOOL ShowWindow( HWND hWnd, int iCommand )' ) || die;
$hWnd = GetConsoleWindow();

sleep 3;#Aspetta tre secondi
ShowWindow($hWnd,0x00 );#Nasconde la finestra

sleep 3;#aspetta tre secondi

ShowWindow($hWnd,0x04 );#Mostra la finestra
sleep 3;
print "cia";
$ciao=<stdin>;
In questo modo non si vedrà tranne che dal taskmenager.
Ciao