Nel caso interessi a qualcuno... ho risolto il problema in questo modo:
non era un problema di scripting, bensì l'ennesimo bug di explorer per quanto riguarda il rendering di pagine html fatte con i css...
In sostanza la mia pagina ha un div all'interno del quale sono contenuti un menu e una serie di altri div. Cliccando i link del menu lo script visualizza il div relativo.
E' bastato applicare un bordo al div "contenitore" per fare impallare explorer...
Tolto il bordo, risolto il problema!
Saluti