La connessione è l'unica cosa che non centra.
Il programma sfrutta una serie di variabili per offire agli utenti un setup più chiaro.

Il tuo problema è che i nomi e le posizioni delle cartelle sul server non sembrano conicidere tra l'FTP e la web version.

In poche parole una cartella che si trova in miosito/pippo/ sul server nel tuo caso sembra trovarsi in miosito/daqualche/parte/nelserver/pippo .

Come detto, usa percorsi assoluti.
Modifila la riga di login da dinamica a fissa con un ritorno a http://miosito.xx/myasg/statistiche.asp