Ho l'impressione che stiate facendo un po' di confusione:

una cosa è il programma Windows Messenger (in qualche modo "parente" di Hotmail) e che è un programma di chat; si può disabilitare in vari modi o anche disinstallare...come avete detto

una cosa BEN DIVERSA è il SERVIZIO MESSENGER a cui si riferisce l'amico sibelium, e che è il responsabile dell'apparizione casuale di pop-up (quasi sempre porno) e che si può solamente disabilitare (andando nella lista dei servizi, fermandolo e mettendolo disabilitato)

Hanno più o meno lo stesso nome ma sono due cose molto diverse