la virgola, in qualsiasi linguaggio, serve per altro che per separare i decimali.
Si puo` trasformare la vigola in punto prima di fare il parseFloat():

var str = document.NOMEFORM.NOMECAMPO.value;
var num = parseFloat(str.replace(/\,/,".");

Nota che ci sono delle backslash: se non le vedi premi il quote inbasso a dx, prima di fare il copia-incolla