penso ke tu avrai visualizzate tt le immagini cn una stessa grandezza e una stessa altezza...
qunado clicchi su ognuna si apre un pop up dove l'immagine sara + grande,giusto???
il tuo problema è ke un immagine nel pop up deve essere 300x300,un'altra 100x100 ,un altra 200x200 ....
ho capito male???

se è cosi,basta ke nel url dove crei il pop up quando gli passi
<a href="javascript: MM_openBrWindow('popup.php?mini=1&altezza=<?php echo $Altezza ?>&grandezza=<?php echo $Width; ?>','','left=0 top=0 width=400 height=368')" style="cursor:hand">

sxo di aver capito...