te ne do un esempio:

filter:chroma(color=#010101);

scrollbar-face-color:#010101;
scrollbar-shadow-color:#111030;
scrollbar-highlight-color:#111030;
scrollbar-3dlight-color:#c0c0c0;
scrollbar-darkshadow-color:#c0c0c0;
scrollbar-track-color:#010101;
scrollbar-arrow-color:#ff0000;

vedi che il primo dice il colore che sarà trasparente e poi dove metti quello hai la trasparenza.
Ovviamente funziona solo con IE!