Originariamente inviato da james
gli unici file nel disco sono quelli presenti sotto /var/lib/mysql/nome_database, e di fatto, se copio in questa posizione file di un database che prima non esisteva, phpmyadmin in automatico rileva il db e lo mette tra lista, solo se sovrascrivo i file si genera questo casotto strano, e se cancello fisicamente il db e rifaccio copia incolla dell'intera directory tutto rifunziona correttamente.
Se puoi scrivere e cancellare non e' una questione di permessi. Potrebbe essere una questione di user? Hai provato a restartare il server?

Ma non ho altre idee....