Anch'io una volta sono incappato in un problema del genere, se non ricordo male all'interno della cartella creata da Front Page dovrebbe esserci un file nascosto... se usi un programma FTP applica un filtro -a (in modo che tu possa visualizzare i file nascosti), poi cancella il file dentro la cartella, una volta cancellato puoi eliminare la cartella.

Ripeto, non ne sono sicuro, ma se nn ricordo male il procedimento dovrebbe essere all'incirca questo.

Famme sapè