Quindi il problema diventa:
impedire allo script di cui sopra di agire nel caso ci sia aperta una finestra di editing.

Questo lo si fa con un semplice test sul href contenuto nella pagina che dovrebbe venir aggiornata:
if(OGGFIN.document.location.href.indexOf('pagina_d i_editing.htm') >=0) { ...

dove OGGFIN deve essere determianto al momento dell'apertura della finestra con:
var OGGFIN = window.open(...);