Li puoi ruotare, con dei software di video editing tipo premiere, vegas, et simila, oppure piu semplicemente con virtual dub.
Vai su video--->filter----> rotate---> e selezioni l'angolo di rotazione.Con virtual dub, per usare i filtri devi per forza ricomprimere il file video, quindi vai su video--> compression---> e li selezioni la compressione che vuoi(DV-DIVX-XVID etc.)
Fatto cio vai su save as avi, selezioni la cartella di destinazione, e aspetti che il processo sia finito.
Ciao