non ho capito una fava, so solo che le scene danno spesso problemi coi riferimenti..
personalmente ti consiglio, se possibile, di dividere il filmato in movieclip al posto che in scene anche perché questi li puoi "guidare" come ti pare.. e poi di dare un'"etichetta" ai fotogrammi (dal pannello proprietà) e mandare i riferimenti all'etichetta al posto che al numero del fotogramma.. ti eviti tanti problemi..