siamo d' accordo che non funzionerebbe ma i parametri servono anche per questo
quando c' è codice da ripetere molte volte (non so se è il tuo caso) conviene sempre una funzione sola con i parametri necessari

es. all' osso
codice:
<script type="text/javascript">
<!--
function apri_prodotto(cod){
  window.open('pop_prodotto.php?codice='+cod,'_blank','width=320,height=240,resizable=0,scrollbars=0');
}
//-->
</script>
<a href=\"#prodotto.php\" onclick=\"apri_prodotto('$codice');return false\" class=\"link2\">LINK POPUP</a>