il doppio kernel serve nel caso quello nuovo venga compilato male e non ti parta più la macchina, quindi tienilo, male non fa

però non ho capito bene ciò che hai fatto: sei passato dal 2.5.x al 2.6.6-1.435.2.3

a parte che non ho mai visto una versione così lunga per un kernel, il 2.5.x non è dichiarato stabile, come faceva ad andarti?