Usando jar da linea di comando

jar mcf archivio.jar manifest.mf *.class

Questo crea il file jar includendo tutti i file class (se vuoi aggiungere altri file come immagini, ecc basta elencarli in coda)

Il file manifest deve contenere l'indicazione della classe che contiene il main


Per lanciare il programma poi:

java -jar archivio.jar