Ciao,
la domanda non è molto chiara.
Se ho capito bene tu vorresti che data una pagina su cui c'è un form di login, l'utente inserisca username e password e dopo il submit venga indirizzato ad una drectory che è protetta tramite password del webserver, senza che la stessa gli venga chiesta di nuovo tramite pop-up.
Se è così c'è una strada ma non è molto sicura.
in pratica devi fare in modo che il CGI ricevuti i dati effettui un reindirizzamento ad un URL composto così:
http://username:password@www.tuosito...ctory_protetta