bhe penso che il problema e che cambiando scheda madre cambia ancke la disposizione dove hai messo la scheda video, quindi cambia la scheda pci che utilizzi.... io non sono bravo con linux quindi il mio consiglio sarebbe di reinstallare la mk10, ma forse ti conviene aspettare quacuno qui dei geni di linux... a me mi hanno sempre aiutato.
Buona fortuna